尾張藩士の家に生まれ、本草学の研究会「嘗百社」で中心的役割を果たした。 伊藤圭介、大河内存真と共に、シーボルト熱田投宿の折に会見した。
各地域に精力的に採薬行に出かけ、ヒトツバタゴ（天然記念物、絶滅危惧種）を発見、命名した。

安永8（1779）年4月19日、尾張藩士水谷覚夢の子として生まれた。父覚夢に本草学を学んだ後、御薬園御用となって尾張藩に仕えた。伊勢、近江、美濃、木曽等に採薬行にでかけるかたわら、浅野春道や大河内存真らと共に「本草会」と称する会合を開き、薬物の鑑定や本草学習を行った。これを継承する形で、尾張の本草学研究会として有名な「嘗百社」が誕生、豊文はその中心として活躍した。
文政9（1826）年シーボルトが熱田に投宿した時、伊藤圭介、大河内存真らと共に会見した。当時、豊文47歳、シーボルト29歳。これ以前に手紙でのやりとりはあったようだ。シーボルトは著書『江戸参府紀行』の中で豊文を「博物学の偉大な友」とたたえ、彼らが持ってきた収集物について詳述している。
水谷豊文が採薬に出かけていたのは、主に文化年間（20代後半から30代にかけて）のようだが、犬山市のヒトツバタゴ自生地に立つ解説文では、文政年間（40代か）に発見したとあり、年齢を重ねても精力的に採薬に出かけていたことがうかがえる。天保4（1833）年3月20日没。
ヒトツバタゴは、木曽川流域の東海地方、岐阜県東濃地方、長崎県対馬など、限られた場所にしか自生していないという。大正12（1923）年に国指定天然記念物となっており、環境省の絶滅危惧種にも指定されている。
名古屋近郊の犬山市にヒトツバタゴ自生地がある。５月になると雪が降ったように真っ白な花を咲かせ、開花の時期には多くの見学者が訪れる。周辺の入鹿池や尾張三山（尾張富士、尾張白山、本宮山）に足を伸ばせば、素晴らしい景色を楽しめる。本宮山山頂からは、豊文が採薬に行ったであろう、伊吹山（薬草で有名）も望むことができる。気候が良くなったら訪れてみよう。

• 『水谷豊文翁之伝』吉川芳秋／著　中京植物学会　1927
• 『医学・洋学・本草学者の研究』吉川芳秋／著　八坂書房　1993
• 『独人蘭医シーボルトをめぐる尾張周辺の人々』吉川芳秋／著　愛知県医師会　1977
• 『江戸参府紀行（東洋文庫）』シーボルト／[著] 斎藤信／訳　平凡社　1967
• 「尾張の嘗百社とその周辺」磯野直秀 田中誠,慶應義塾大学日吉紀要. 自然科学. No.47 (2010),p.15-39
• 「小牧」2万5千分の1地形図　国土地理院　2018
• 『犬山市天然記念物ヒトツバタゴ自生地』（犬山市公式サイト　外部リンク）（最終確認日：2020年7月15日）

• 発見！名古屋の偉人伝No.023　水谷豊文（みずたに・とよぶみ／ほうぶん）の巻　＜PDF形式，257KB＞（2020年8月作成）

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